动态规划之公共子序列/子串/前缀

2018/03/13 Algorithms 共 3316 字,约 10 分钟

最长公共子序列

这个这个最长公共子序列是非连续的,比如1234和42354的最长公共子序列为234

最优子结构性质:

设序列 X=<x1, x2, …, xm> 和 Y=<y1, y2, …, yn> 的一个最长公共子序列 Z=<z1, z2, …, zk>,则:

若 xm ≠ yn, 要么Z是 Xm-1 和 Y 的最长公共子序列,要么 Z 是X和 Yn-1 的最长公共子序列。

2.1 若 xm ≠ yn 且 zk≠xm ,则 Z是 Xm-1 和 Y 的最长公共子序列;

2.2 若 xm ≠ yn 且 zk ≠yn ,则 Z 是X和 Yn-1 的最长公共子序列。

综合一下2 就是求二者的大者

计算最优值:

子问题空间中,总共只有O(m*n) 个不同的子问题,因此,用动态规划算法自底向上地计算最优值能提高算法的效率。

长度表C 和 方向变量B:

与最长递增子序列相比,最长公共子序列有以下不同点:

针对的是两个序列,求它们的最长公共子序列。

在最长递增子序列中,dp[i] 表示以 Si 为结尾的最长递增子序列长度,子序列必须包含 Si ;在最长公共子序列中,dp[i][j] 表示 S1 中前 i 个字符与 S2 中前 j 个字符的最长公共子序列长度,不一定包含 S1i 和 S2j 。

在求最终解时,最长公共子序列中 dp[N][M] 就是最终解,而最长递增子序列中 dp[N] 不是最终解,因为以 SN 为结尾的最长递增子序列不一定是整个序列最长递增子序列,需要遍历一遍 dp 数组找到最大者。

 /* 动态规划
 * 求最长公共子序列
 * @ author by gsm
 * @ 2015.4.1
 */
import java.util.Random;
public class LCS {

    public static int[][] lengthofLCS(char[] X, char[] Y){
        /* 构造二维数组c[][]记录X[i]和Y[j]的LCS长度 (i,j)是前缀
         * c[i][j]=0; 当 i = j = 0;
         * c[i][j]=c[i-1][j-1]+1; 当 i = j > 0; Xi == Y[i]
         * c[i][j]=max(c[i-1][j],c[i][j+1]); 当 i = j > 0; Xi != Y[i]
         * 需要计算 m*n 个子问题的长度 即 任意c[i][j]的长度
         * -- 填表过程
         */
        int[][]c = new int[X.length+1][Y.length+1];

        // 动态规划计算所有子问题
        for(int i=1;i<=X.length;i++){
            for (int j=1;j<=Y.length;j++){
                if(X[i-1]==Y[j-1]){
                    c[i][j] = c[i-1][j-1]+1;
                }
                else if(c[i-1][j] >= c[i][j-1]){
                    c[i][j] = c[i-1][j];
                }
                else{
                    c[i][j] = c[i][j-1];
                }
            }
        }

        // 打印C数组
        for(int i=0;i<=X.length;i++){
            for (int j=0;j<=Y.length;j++){
                System.out.print(c[i][j]+" ");
            }
            System.out.println();
        }
        return c;
    }
    // 输出LCS序列
    public static void print(int[][] arr, char[] X, char[] Y, int i, int j) {
        if(i == 0 || j == 0)
            return;
        if(X[i-1] == Y[j-1]) {
            System.out.print("element " + X[i-1] + " ");
            // 寻找的
            print(arr, X, Y, i-1, j-1);
        }else if(arr[i-1][j] >= arr[i][j-1]) {
            print(arr, X, Y, i-1, j);
        }else{
            print(arr, X, Y, i, j-1);
        }
    }
    public static void main(String[] args) {
        // TODO Auto-generated method stub
        char[] x ={'A','B','C','B','D','A','B'}; 
        char[] y ={'B','D','C','A','B','A'}; 
        int[][] c = lengthofLCS(x,y);
        print(c, x, y, x.length, y.length);
    }
}



精简版

public int lengthOfLCS(int[] nums1, int[] nums2) {
    int n1 = nums1.length, n2 = nums2.length;
    int[][] dp = new int[n1 + 1][n2 + 1];
    for (int i = 1; i <= n1; i++) {
        for (int j = 1; j <= n2; j++) {
            if (nums1[i - 1] == nums2[j - 1]) {
                dp[i][j] = dp[i - 1][j - 1] + 1;
            } else {
                dp[i][j] = Math.max(dp[i - 1][j], dp[i][j - 1]);
            }
        }
    }
    return dp[n1][n2];
}

最长公共子串

一个问题

定义 2 个字符串 query 和 text, 如果 query 里最大连续字符子串在 text 中存在,则返回子串长度. 例如: query=”acbac”,text=”acaccbabb”, 则最大连续子串为 “cba”, 则返回长度 3.

方法

时间复杂度:O(m*n)的DP 这个 LCS 跟前面说的最长公共子序列的 LCS 不一样,不过也算是 LCS 的一个变体,在 LCS 中,子序列是不必要求连续的,而子串则是 “连续” 的

我们还是像之前一样 “从后向前” 考虑是否能分解这个问题,类似最长公共子序列的分析,这里,我们使用c[i,j] 表示 以 Xi 和 Yj 结尾的最长公共子串的长度,因为要求子串连续,所以对于 Xi 与 Yj 来讲,它们要么与之前的公共子串构成新的公共子串;要么就是不构成公共子串。故状态转移方程

X[i-1] == Y[j-1],c[i,j] = c[i-1,j-1] + 1;

X[i-1] != Y[j-1],c[i,j] = 0;

对于初始化,i==0 或者 j==0,c[i,j] = 0

public class LCString {
    public  static int lengthofLCString(String X, String Y){
        /* 构造二维数组c[][]记录X[i]和Y[j]的LCS长度 (i,j)是前缀
         * c[i][j]=0; 当 i = j = 0;
         * c[i][j]=c[i-1][j-1]+1; 当 i = j > 0; Xi == Y[i]
         * c[i][j]=0; 当 i = j > 0; Xi != Y[i]
         * 需要计算 m*n 个子问题的长度 即 任意c[i][j]的长度
         * -- 填表过程
         */
        int[][]c = new int[X.length()+1][Y.length()+1];
        int maxlen = 0;
        int maxindex = 0;
        for(int i =1;i<=X.length();i++){
            for(int j=1;j<=Y.length();j++){
                if(X.charAt(i-1) == Y.charAt(j-1)){
                    c[i][j] = c[i-1][j-1]+1;
                    if(c[i][j] > maxlen)
                    {
                        maxlen = c[i][j];
                        maxindex = i + 1 - maxlen;
                    }
                }
            }
        }
        return maxlen;
    }

    public static void main(String[] args) {
        String X = "acbac";
        String Y = "acaccbabb";
        System.out.println(lengthofLCString(X,Y)); 
    }
}

最长前缀LCP Longest common prefix

求两个字符串任意两个位置开头的最长公共前缀。时间复杂度o(n2) 如果是暴力需要o(n3) 枚举i,j然后到头。

class Strings:
    def LongestCommonPrefix(a, b):
        # lcp[i][j] 表示 s[i:] 和 s[j:] 的最长公共前缀
        n, m = len(a), len(b)
        lcp = [[0] * (m + 1) for _ in range(n + 1)]
        for i in range(n - 1, -1, -1):
            for j in range(m - 1, -1, -1):
                if a[i] == b[j]:
                    lcp[i][j] = lcp[i + 1][j + 1] + 1
        return lcp

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